Il Museo è ospitato nel Palazzo dell'imperatore Massimiliano I e costituisce una realtà preziosa nell'ambito dei musei naturalistici. Organizzato come un moderno centro di documentazione, il Museo presenta la storia geologica e ambientale dell'Alto Adige, mediante vetrine, stazioni multimediali, diorami, plastici; inoltre organizza mostre temporanee e itineranti, con lo scopo di approfondire particolari aspetti della flora o della fauna locali.

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