Gli Istituti Ortopedici Rizzoli ospitano due biblioteche scientifiche di enorme valore,
sorte grazie soprattutto alla passione per la ricerca e la collezione di testi di medicina dell'eminente ortopedico Vittorio Putti. Fu quest'ultimo, infatti a intraprendere una lunga attività di collezione e cura di libri rari di medicina, che fu donata alla sua morte all'Istituto, e che oggi possiamo ammirare nei locali che Putti stesso aveva adibito a studio e biblioteca. La Donazione che porta il suo nome, oggi, è famosa a livello mondiale e rappresenta una raccolta di valore inestimabile. Si tratta di circa 1000 testi, tra i quali, oltre ai padri fondatori della medicina, da Ippocrate ad Avicenna, sono presenti una prima edizione di Vesalio, il Fasciculus Ketham, primo testo di medicina illustrato, e il primo testo di ortopedia di Nicholas Andry. Completano la collezione libraria, una quadreria di ritratti, una raccolta di strumenti chirurgici dall'antichità romana all'Ottocento e due manichini d'avorio che nel Cinquecento venivano usati per la didattica. Anche l'altra biblioteca presente nell'Istituto fu organizzata da Putti sulla base della raccolta di testi difficile da eguagliare, sia per la preziosità dei pezzi contenuti, sia per il carattere esauriente dei titoli presenti in merito alla medicina ortopedica. Questa collezione fu finanziata dalla provincia di Bologna nel 1900 e collocata in uno spazio dedicato al re d'Italia di allora. La raccolta invece è intitolata ai professor Rizzoli, fondatore dell'Istituto, e al chirurgo eminente Alessandro Codivilla, considerato il padre dell'ortopedia in Italia.

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