Il Museo è dedicato al suo fondatore Enrico Caffi (1866-1948) e comprende raccolte geologiche, botaniche, zoologiche ed etnografiche. Nell'ingresso del Museo si è subito rapiti dalla ricostruzione a grandezza naturale di un Mammut, che introduce la visita alle collezioni dei Vertebrati (pesci, anfibi, rettili e uccelli), dei Mammiferi e degli Artropodi. Nella sezione di Paleontologia si segnala la ricostruzione dello scheletro di un dinosauro carnivoro del Giurassico ed una documentazione delle ultime scoperte sull'origine, l'evoluzione, le caratteristiche e le abitudini dei dinosauri. La visita prosegue nella sezione geologica, che illustra i cambiamenti subiti dal territorio nel corso dei millenni, con particolare attenzione al fenomento del Carsismo, diffuso nella zona bergamasca.

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